22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1472 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  36.4 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  37.77 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  35.06 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  32.92 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  40.82 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  32.86 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  31.58 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  27.51 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  27.07 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.85 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  25.34 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  27.62 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  26.41 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  26.96 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  26.55 
 
 		 148 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  22.83 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1640  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2306  hypothetical protein  33.04 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  27.56 
 
 		 212 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>