14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3986 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  84.65 
 
 
253 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  81.5 
 
 
253 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  51.82 
 
 
272 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  48.39 
 
 
268 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  47.42 
 
 
247 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  46.58 
 
 
253 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  52.26 
 
 
267 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  43.95 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  39.45 
 
 
235 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  40.64 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  44.65 
 
 
273 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  37.91 
 
 
196 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  29.7 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>