18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0336 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0336  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  217  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2144  hypothetical protein  54.9 
 
 
111 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1436  DRTGG domain-containing protein  49.5 
 
 
107 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0094  HPr kinase  42.59 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0913  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1476  hypothetical protein  36.27 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1430  hypothetical protein  36.84 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3797  hypothetical protein  32.38 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0803  hypothetical protein  37.37 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0913  hypothetical protein  43.04 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0693  HPr kinase  30.56 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0177  iron-sulfur binding hydrogenase  33 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1293  hypothetical protein  30.86 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0333  hypothetical protein  35.19 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0690  hypothetical protein  28.85 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3800  DRTGG domain-containing protein  26.26 
 
 
116 aa  43.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000241054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2147  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1908  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>