22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1183 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  81.93 
 
 
168 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  74.7 
 
 
167 aa  260  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  71.08 
 
 
182 aa  244  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  41.57 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  42.17 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  40.49 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  40.96 
 
 
166 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  39.16 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  35.37 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  38.12 
 
 
201 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  36.2 
 
 
175 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  33.94 
 
 
170 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  33.73 
 
 
170 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  29.49 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  36.67 
 
 
204 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1710  hypothetical protein  69.23 
 
 
55 aa  75.1  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  26.14 
 
 
201 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  26.35 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  24.03 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  30.48 
 
 
212 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>