16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0056 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  100 
 
 		 353 aa  696    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  47.31 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  47.31 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  47.03 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  39.73 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000345136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  37.98 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000317042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  30.75 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  29.6 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  31.3 
 
 		 357 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  32.42 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  27.5 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  29.91 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  32.38 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.7 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  21.6 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  26.79 
 
 		 594 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>