16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0056 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  100 
 
 
353 aa  696  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.12269e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  47.31 
 
 
345 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  47.31 
 
 
345 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  47.03 
 
 
345 aa  274  2e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  39.73 
 
 
364 aa  212  8e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.45136e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  37.98 
 
 
365 aa  196  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  3.17042e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  30.75 
 
 
353 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  29.6 
 
 
368 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  31.3 
 
 
357 aa  140  5e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  8.26676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  32.42 
 
 
354 aa  128  2e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  27.5 
 
 
431 aa  55.1  2e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  29.91 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  32.38 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.7 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  21.6 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  26.79 
 
 
594 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>