27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1767 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1767  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.185384  decreased coverage  0.00269741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3488  hypothetical protein  55.87 
 
 
366 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.120509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2102  hypothetical protein  55.03 
 
 
378 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.030663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2350  hypothetical protein  55.05 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  0.439683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0151  hypothetical protein  48.86 
 
 
364 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.549779  normal  0.66051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4754  hypothetical protein  52.87 
 
 
360 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0500  hypothetical protein  48.73 
 
 
385 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.380847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1639  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  212  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2285  hypothetical protein  44.38 
 
 
361 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2576  hypothetical protein  43.14 
 
 
363 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306519  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3792  hypothetical protein  38.68 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.824525  normal  0.342808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2108  hypothetical protein  44.77 
 
 
377 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1700  hypothetical protein  39.22 
 
 
434 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.0852804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3949  hypothetical protein  40.52 
 
 
355 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1811  putative lipoprotein  41.24 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.213337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2805  putative lipoprotein  41.41 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1696  hypothetical protein  41.41 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2906  hypothetical protein  41.41 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2381  hypothetical protein  41.41 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2682  hypothetical protein  41.41 
 
 
377 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2740  hypothetical protein  41.08 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.066802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1388  hypothetical protein  38.58 
 
 
384 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6121  hypothetical protein  58.25 
 
 
381 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0698534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1828  hypothetical protein  33.03 
 
 
366 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4726  hypothetical protein  38.14 
 
 
387 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926949  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1487  hypothetical protein  37.84 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0540856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4253  hypothetical protein  56 
 
 
99 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>