16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0431 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  100 
 
 
368 aa  717    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  42.55 
 
 
365 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000317042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  40.38 
 
 
353 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  38.75 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000345136  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  30.08 
 
 
357 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  35.05 
 
 
345 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  34.78 
 
 
345 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  34.78 
 
 
345 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  29.6 
 
 
353 aa  143  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  27.91 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.83 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  26.57 
 
 
427 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  28.42 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.12 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.77 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  26.78 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>