15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00055 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00055  elongation factor Tu  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0420  preprotein translocase, SecE subunit  60 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000015619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1937  preprotein translocase, SecE subunit  55.38 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4483  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00005242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3455  preprotein translocase, SecE subunit  36.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00261643  normal  0.0335221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1701  preprotein translocase, SecE subunit  30.91 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0108119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0843  preprotein translocase, SecE subunit  31.15 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.481373 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0496  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 126 aa  42  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1402  hypothetical protein  35.19 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>