10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1567 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  53 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  46 
 
 		 224 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  45.92 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  51.28 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  44.62 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  38.46 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  41.67 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>