33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  100 
 
 
326 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  29.02 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.65 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  38.61 
 
 
592 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.72 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.69 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.28 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.53 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.97 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.63 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.98 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000015998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  30.8 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  31.85 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  23.21 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.99 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.49 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2660  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.62 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  22.87 
 
 
468 aa  62.4  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.31 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  30.63 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  27.3 
 
 
293 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.97 
 
 
270 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  26.13 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  29.56 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  27.76 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  26.64 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.69 
 
 
264 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.62 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.98 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  29.35 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  29.24 
 
 
266 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>