29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6983 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  247  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  88.12 
 
 
101 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  82.86 
 
 
105 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  56.6 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  44.93 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  51.92 
 
 
92 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  42.25 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  50 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  52.38 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  51.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  55.81 
 
 
110 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  55.81 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  55.81 
 
 
110 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  54.76 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  39.13 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  54.76 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  54.76 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  52 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  56.82 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  39.13 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  46.81 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  60 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  54.55 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>