20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1771 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1771  membrane-associated protein  100 
 
 		 184 aa  352  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.315359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0645  SNARE associated Golgi protein  65.08 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2186  membrane-associated protein  45.95 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0769263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0598  hypothetical protein  46.31 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17120  uncharacterized membrane-associated protein  49.14 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.647778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0158  SNARE associated Golgi protein-related protein  50.46 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1971  hypothetical protein  38.62 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1537  hypothetical protein  43.93 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.71865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13640  hypothetical protein  48.31 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19940  uncharacterized membrane-associated protein  38.27 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7633  membrane-associated protein-like protein  33.66 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  24.31 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  32.63 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  24.56 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.5 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  27.18 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  32.18 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  26.67 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>