17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1569 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1569  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  361  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  decreased coverage  0.00826206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0757  hypothetical protein  43.14 
 
 
154 aa  54.3  9e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.479528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5062  hypothetical protein  23.26 
 
 
195 aa  49.3  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0385072  normal  0.856159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  37.25 
 
 
178 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  35.71 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0059  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  30.61 
 
 
370 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
819 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  30.51 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2075  hypothetical protein  20.99 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.564114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
723 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3358  hypothetical protein  21.84 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1563  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  38.78 
 
 
1186 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  30.61 
 
 
400 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  30.61 
 
 
400 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  40 
 
 
404 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0920  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  38.78 
 
 
1181 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.438288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>