44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7481 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7481  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0069483  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6166  photosystem I assembly BtpA  86.02 
 
 		 280 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474766 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3693  BtpA protein  78.78 
 
 		 280 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3428  photosystem I assembly BtpA  79.85 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1474  photosystem I assembly BtpA  61.09 
 
 		 279 aa  327  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3868  photosystem I assembly BtpA  41.95 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2015  photosystem I assembly BtpA  42.11 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0541  photosystem I assembly BtpA  41.2 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1521  photosystem I assembly BtpA  38.1 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0445  photosystem I assembly BtpA  36.7 
 
 		 282 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3031  photosystem I assembly BtpA  38.87 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0235  photosystem I assembly BtpA  38.17 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.569155  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0640  photosystem I assembly BtpA  37.17 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3089  photosystem I assembly BtpA  38.49 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0469  photosystem I assembly BtpA  36.8 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1136  photosystem I assembly BtpA  36.22 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0171957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2513  photosystem I assembly BtpA  35.45 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.145919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4795  photosystem I assembly BtpA  35.58 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1082  photosystem I assembly BtpA  34.9 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3523  photosystem I assembly BtpA  35.71 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2116  photosystem I assembly BtpA  38.97 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2153  photosystem I assembly BtpA  36.47 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2112  photosystem I assembly BtpA  30.56 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.348808  normal  0.986684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04130  hypothetical protein  28.46 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3697  photosystem I assembly BtpA  28.46 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04168  predicted nucleoside triphosphatase  28.46 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1266  photosystem I assembly BtpA  29.84 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1793  hypothetical protein  28.46 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.380259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1546  hypothetical protein  28.09 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1732  hypothetical protein  28.09 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1729  hypothetical protein  28.09 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3314  photosystem I assembly BtpA  29.55 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2619  photosystem I assembly BtpA  27.68 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.509941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3749  photosystem I assembly BtpA  27.34 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1727  hypothetical protein  28.09 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19381  normal  0.3665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0929  photosystem I assembly BtpA  32.34 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.28389  normal  0.101264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3780  photosystem I assembly BtpA  25.83 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.579042  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0889  photosystem I assembly BtpA  30.89 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1621  photosystem I assembly BtpA  30.47 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.123371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3686  photosystem I assembly BtpA  25.47 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1972  photosystem I assembly BtpA  31.58 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2423  photosystem I assembly BtpA  24.71 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2462  photosystem I assembly BtpA  24.71 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2468  photosystem I assembly BtpA  24.71 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>