14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0018 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  73.08 
 
 
53 aa  79  2e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  68 
 
 
51 aa  69.3  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  55.77 
 
 
96 aa  62.4  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  60.78 
 
 
69 aa  60.5  7e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  60.42 
 
 
94 aa  59.7  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03370  hypothetical protein  60 
 
 
53 aa  52  3e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  55.32 
 
 
71 aa  50.1  9e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  56.86 
 
 
67 aa  47  8e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0838  hypothetical protein  65.38 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6134  hypothetical protein  45.1 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0040  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0375  hypothetical protein  43.14 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  53.06 
 
 
51 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>