More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0402 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  100 
 
 		 93 aa  191  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  77.42 
 
 		 93 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  77.42 
 
 		 93 aa  154  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  78.49 
 
 		 93 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  75 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 93 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  79.76 
 
 		 94 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 		 92 aa  146  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 		 93 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  73.12 
 
 		 93 aa  146  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  146  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  69.57 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  144  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  144  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  74.19 
 
 		 93 aa  143  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  75 
 
 		 94 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  143  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 93 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  69.89 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  73.12 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  70.97 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  65.59 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  70.97 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  68.09 
 
 		 94 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  74.12 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  69.89 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  69.32 
 
 		 90 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 		 93 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 		 93 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  67.39 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  65.91 
 
 		 94 aa  136  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  73.81 
 
 		 86 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>