11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0017 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0017  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  55.77 
 
 
96 aa  62.4  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  55.77 
 
 
94 aa  62  3e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  53.85 
 
 
53 aa  55.5  2e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  55.1 
 
 
51 aa  54.3  5e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  52 
 
 
51 aa  50.1  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  55.1 
 
 
52 aa  47.4  6e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  42 
 
 
69 aa  47  8e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0838  hypothetical protein  55.77 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  48.94 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>