13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1197 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1197  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00120009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0546  hypothetical protein  54.6 
 
 
175 aa  179  5e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.100734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0560  hypothetical protein  54.6 
 
 
175 aa  179  5e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0302  hypothetical protein  55.17 
 
 
184 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81241  normal  0.260397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07390  hypothetical protein  43.5 
 
 
187 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.423973  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3956  hypothetical protein  45.28 
 
 
170 aa  115  9e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2710  hypothetical protein  42.05 
 
 
164 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.424321 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2749  hypothetical protein  38.71 
 
 
92 aa  61.2  2e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.448034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7412  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  55.1  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2512  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5565  hypothetical protein  38.55 
 
 
104 aa  54.3  2e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.123926 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4150  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  53.5  4e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1028  hypothetical protein  32.89 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.354619  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4473  hypothetical protein  57.58 
 
 
162 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>