29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1075 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  743  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  35.48 
 
 
283 aa  80.9  3e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.48 
 
 
255 aa  80.9  4e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  28.91 
 
 
302 aa  69.7  9e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  28.52 
 
 
302 aa  67.4  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  25.68 
 
 
272 aa  59.3  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  27.5 
 
 
182 aa  57.4  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  26.11 
 
 
280 aa  54.7  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.3 
 
 
257 aa  54.7  3e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  1.39676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.66 
 
 
252 aa  53.9  4e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  30.95 
 
 
203 aa  53.1  7e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  53.1  7e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.2 
 
 
252 aa  52.8  9e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.42 
 
 
257 aa  52.4  1e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.5188e-05  hitchhiker  2.23583e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.47 
 
 
252 aa  51.6  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26 
 
 
268 aa  51.2  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  27.14 
 
 
201 aa  51.2  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  27.14 
 
 
201 aa  51.2  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  29.06 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.07 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  36 
 
 
399 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  25.11 
 
 
256 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  37.84 
 
 
225 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.84 
 
 
178 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  23.2 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.66 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.01 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  29.22 
 
 
193 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.66 
 
 
286 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>