28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3461 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  100 
 
 
557 aa  1117    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  94.62 
 
 
557 aa  985    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  98.56 
 
 
557 aa  1105    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  64.48 
 
 
505 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  36.12 
 
 
610 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  23.31 
 
 
358 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  23.04 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  22.58 
 
 
361 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  23.04 
 
 
358 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  22.76 
 
 
368 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  22.76 
 
 
358 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  22.49 
 
 
358 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  22.76 
 
 
358 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  22.76 
 
 
358 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  22.76 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  22.49 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  23.04 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  20.49 
 
 
364 aa  77  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  25.67 
 
 
569 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1128  hypothetical protein  27.41 
 
 
367 aa  55.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.2 
 
 
533 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  27.59 
 
 
485 aa  50.8  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  25.2 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  24.71 
 
 
536 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  25.68 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  23.74 
 
 
819 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07671  hypothetical protein  29.75 
 
 
872 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  26.29 
 
 
538 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>