49 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SeAg_B0048  CDS  NC_011149  52277  52540  -  264  30S ribosomal protein S20  YP_002145024  unclonable  0.0000000000000161385  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0482  CDS  NC_011149  478735  479664  -  930  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  YP_002145424  unclonable  0.00000000000191941  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0510  CDS  NC_011149  507897  508157  +  261  50S ribosomal protein L31 type B  YP_002145450  unclonable  0.0000000000000510204  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0725  CDS  NC_011149  714171  714854  -  684  integrase, catalytic region  YP_002145650  unclonable  0.00000000000044412  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0741  CDS  NC_011149  733928  734557  -  630  flavodoxin FldA  YP_002145666  unclonable  0.00000000000041401  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0742  CDS  NC_011149  734609  734902  -  294  LexA regulated protein  YP_002145667  unclonable  0.0000000000000825535  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0743  CDS  NC_011149  735036  735806  -  771  hypothetical protein  YP_002145668  unclonable  0.000000000000786446  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0744  CDS  NC_011149  735991  736533  +  543  replication initiation regulator SeqA  YP_002145669  unclonable  0.000000000000288551  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0787  tRNA  NC_011149  782719  782796  +  78  tRNA-Lys    unclonable  0.0000000000000114753  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0788  tRNA  NC_011149  782932  783007  +  76  tRNA-Val    unclonable  0.000000000000010379  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0789  tRNA  NC_011149  783011  783086  +  76  tRNA-Lys    unclonable  0.00000000000000938184  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1028  CDS  NC_011149  1030515  1031630  -  1116  outer membrane protein A  YP_002145940  unclonable  0.00000000000286695  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1134  ncRNA  NC_011149  1136548  1136631  +  84  DsrA RNA    unclonable  0.0000000000000335092  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1175  CDS  NC_011149  1168239  1168787  +  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_002146078  unclonable  0.000000000000144583  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1176  tRNA  NC_011149  1168939  1169014  +  76  tRNA-Gly    unclonable  0.0000000000000120685  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1177  tRNA  NC_011149  1169067  1169140  +  74  tRNA-Cys    unclonable  0.00000000000000957331  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1178  tRNA  NC_011149  1169152  1169238  +  87  tRNA-Leu    unclonable  0.0000000000000100662  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1179  CDS  NC_011149  1169315  1169443  +  129  hypothetical protein  YP_002146079  unclonable  0.0000000000000130763  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1316  CDS  NC_011149  1285487  1286614  +  1128  ribonuclease D  YP_002146207  unclonable  0.0000000000119147  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1332  CDS  NC_011149  1299093  1300826  -  1734  potassium/proton antiporter  YP_002146223  unclonable  0.0000000000612144  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1441  CDS  NC_011149  1400325  1401494  +  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_002146321  unclonable  0.00000000000153911  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1576  CDS  NC_011149  1539712  1541205  -  1494  L-asparagine permease  YP_002146451  unclonable  0.0000000000285451  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1793  CDS  NC_011149  1754644  1756056  +  1413  pyruvate kinase  YP_002146661  unclonable  0.0000000000263395  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1794  CDS  NC_011149  1756367  1756603  +  237  major outer membrane lipoprotein  YP_002146662  unclonable  0.0000000000000710111  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1841  CDS  NC_011149  1804042  1804896  -  855  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_002146705  unclonable  0.00000000000036697  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1990  CDS  NC_011149  1933780  1934016  -  237  acyl carrier protein  YP_002146847  unclonable  0.0000000000000274294  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1991  CDS  NC_011149  1934172  1934906  -  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_002146848  unclonable  0.000000000000378223  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1996  CDS  NC_011149  1938335  1938856  -  522  hypothetical protein  YP_002146853  unclonable  0.0000000000000850849  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2066  CDS  NC_011149  1995376  1996173  +  798  hypothetical protein  YP_002146917  unclonable  0.000000000000683564  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2067  tRNA  NC_011149  1996273  1996350  +  78  tRNA-Asn    unclonable  0.0000000000000248141  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2115  tRNA  NC_011149  2038000  2038077  -  78  tRNA-Asn    unclonable  0.0000000000000335092  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2116    NC_011149  2038217  2039743  -  1527      unclonable  0.0000000000325483  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2469  CDS  NC_011149  2401806  2402744  -  939  HTH-type transcriptional regulator PecT  YP_002147288  unclonable  0.00000000000182505  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2572  CDS  NC_011149  2502442  2503428  -  987  cell division protein ZipA  YP_002147381  unclonable  0.0000000000023932  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2661  CDS  NC_011149  2593563  2594912  +  1350  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_002147465  unclonable  0.000000000015005  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2778  CDS  NC_011149  2722121  2723593  -  1473  hypothetical protein  YP_002147569  unclonable  0.0000000000124034  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3084  CDS  NC_011149  3006330  3007001  -  672  radical SAM domain protein  YP_002147853  unclonable  0.000000000000255818  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3097  CDS  NC_011149  3020308  3022542  -  2235  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_002147866  unclonable  0.00000000040075  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3151  CDS  NC_011149  3079597  3080127  -  531  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_002147913  unclonable  0.00000000000021359  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3485  CDS  NC_011149  3381899  3383842  -  1944  ATP-dependent metalloprotease  YP_002148220  unclonable  0.000000000163816  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3495  CDS  NC_011149  3390415  3391527  +  1113  octaprenyl diphosphate synthase  YP_002148230  unclonable  0.00000000000567296  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3686  CDS  NC_011149  3558862  3559383  -  522  shikimate kinase I  YP_002148408  unclonable  0.00000000000028278  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4382  CDS  NC_011149  4277337  4278287  -  951  pantothenate kinase  YP_002149055  unclonable  0.000000000000669891  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4383  tRNA  NC_011149  4278688  4278765  +  78  tRNA-Thr    unclonable  0.0000000000000102716  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4384  tRNA  NC_011149  4278773  4278857  +  85  tRNA-Tyr    unclonable  0.000000000000011593  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4385  CDS  NC_011149  4278872  4278988  +  117  hypothetical protein  YP_002149056  unclonable  0.0000000000000133432  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4386  tRNA  NC_011149  4278974  4279048  +  75  tRNA-Gly    unclonable  0.0000000000000113588  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4387  tRNA  NC_011149  4279054  4279131  +  78  tRNA-Thr    unclonable  0.0000000000000102716  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4388  CDS  NC_011149  4279246  4280430  +  1185  elongation factor Tu  YP_002149057  unclonable  0.0000000000036113  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>