42 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BURPS1710b_0001  rRNA  NC_007434  533  648  -  116  5S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000000461312  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0002  rRNA  NC_007434  830  3711  -  2882  23S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000280391  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0003  tRNA  NC_007434  4065  4140  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.0000000000586808  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0004  tRNA  NC_007434  4175  4251  -  77  tRNA-Ile    unclonable  0.0000000000586808  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0005  rRNA  NC_007434  4334  5821  -  1488  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000000129468  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0026  CDS  NC_007434  31191  32021  +  831  OmpW family outer membrane protein  YP_331444  unclonable  0.000000000541983  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0027  CDS  NC_007434  32208  33146  -  939  transcriptional regulatory protein  YP_331445  unclonable  0.000000000739069  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0320  CDS  NC_007434  333973  335478  -  1506  hypothetical protein  YP_331735  unclonable  0.00000000253408  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0321  CDS  NC_007434  334989  335405  -  417  glyoxalase family protein  YP_331737  unclonable  0.000000000322119  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0322  CDS  NC_007434  335807  336901  +  1095  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  YP_331738  unclonable  0.00000000161378  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1113  CDS  NC_007434  1166664  1166978  +  315  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_332526  unclonable  0.0000000000920872  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1114  CDS  NC_007434  1166621  1169275  +  2655  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  YP_332525  unclonable  0.0000000182282  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1115  CDS  NC_007434  1166882  1170730  -  3849  200 kDa antigen p200, putative  YP_332527  unclonable  0.000000201408  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1472  CDS  NC_007434  1542852  1544069  -  1218  hypothetical protein  YP_332881  unclonable  0.000000000930484  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1473  rRNA  NC_007434  1544706  1546193  +  1488  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000000153483  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1953  CDS  NC_007434  2125504  2126235  +  732  hypothetical protein  YP_333352  unclonable  0.000000000297307  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2626  CDS  NC_007434  2906793  2908262  -  1470  hypothetical protein  YP_334013  unclonable  0.00000000164664  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2627  CDS  NC_007434  2906882  2908462  +  1581  hypothetical protein  YP_334014  unclonable  0.00000000222411  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2628  CDS  NC_007434  2907044  2908558  -  1515  glutamyl-tRNA synthetase  YP_334015  unclonable  0.00000000191371  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2933  tRNA  NC_007434  3240254  3240329  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000103893  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2934  tRNA  NC_007434  3240419  3240494  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000107091  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2935  CDS  NC_007434  3240633  3241112  +  480  CreA protein  YP_334314  unclonable  0.000000000238483  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2936  CDS  NC_007434  3241161  3242507  +  1347  hypothetical protein  YP_334315  unclonable  0.000000000867442  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3041  CDS  NC_007434  3354933  3355136  -  204  cold shock transcription regulator protein  YP_334418  unclonable  0.000000000233724  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3776  CDS  NC_007434  4101549  4102208  -  660  50S ribosomal protein L3  YP_335140  unclonable  0.000000000325408  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3797  tRNA  NC_007434  4124739  4124824  -  86  tRNA-Tyr    unclonable  0.0000000000392981  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3798  CDS  NC_007434  4125373  4125492  +  120  IS407A, transposase OrfA  YP_335158  unclonable  0.0000000000480288  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3799  CDS  NC_007434  4125511  4125636  +  126  IS407A, transposase OrfA  YP_335159  unclonable  0.0000000000480288  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1239  CDS  NC_007435  1551217  1551507  -  291  H-NS histone family protein  YP_336396  unclonable  0.0000000000958752  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1497  CDS  NC_007435  1829947  1830504  -  558  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  YP_336654  unclonable  0.000000000255815  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1498  CDS  NC_007435  1830739  1830891  -  153  hypothetical protein  YP_336655  unclonable  0.0000000000998036  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1499  CDS  NC_007435  1830868  1831473  +  606  RNA polymerase sigma factor  YP_336656  unclonable  0.000000000288475  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1570  CDS  NC_007435  1906550  1907071  -  522  H-NS histone family protein  YP_336727  unclonable  0.000000000103893  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1571  CDS  NC_007435  1906848  1908752  +  1905  alpha-ketoglutarate permease  YP_336728  unclonable  0.00000000193325  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2199  CDS  NC_007435  2688840  2689103  +  264  hypothetical protein  YP_337350  unclonable  0.0000000000443154  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2200  CDS  NC_007435  2689339  2689581  -  243  putative terpene cyclase  YP_337351  unclonable  0.0000000000377513  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2201  CDS  NC_007435  2689581  2690390  -  810  putative terpene cyclase  YP_337352  unclonable  0.000000000144579  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2202  CDS  NC_007435  2690419  2690658  +  240  hypothetical protein  YP_337353  unclonable  0.0000000000461312  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2203  CDS  NC_007435  2690728  2691204  +  477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  YP_337354  unclonable  0.0000000000808361  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2204  CDS  NC_007435  2691497  2692156  +  660  glutathione S-transferase-like protein  YP_337355  unclonable  0.0000000000939621  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2205  CDS  NC_007435  2692197  2692907  +  711  hypothetical protein  YP_337356  unclonable  0.000000000209346  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2206  CDS  NC_007435  2692957  2693253  +  297  hypothetical protein  YP_337357  unclonable  0.0000000000816613  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>