14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1958 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1958  major outer membrane protein  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1952  major outer membrane protein  99.33 
 
 
297 aa  607  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3033  major outer membrane protein precursor  80.13 
 
 
289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2890  major outer membrane protein  80.13 
 
 
288 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2891  major outer membrane protein precursor  80.13 
 
 
288 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3032  major outer membrane protein  79.8 
 
 
289 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2148  hypothetical protein  41.77 
 
 
325 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2889  hypothetical protein  41.49 
 
 
321 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3031  hypothetical protein  41.54 
 
 
323 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0671  hypothetical protein  28.78 
 
 
363 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0655  hypothetical protein  28.49 
 
 
363 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1942  hypothetical protein  27.11 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0519  hypothetical protein  29.95 
 
 
392 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.29913e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0609  hypothetical protein  24.13 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>