15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2307 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2307  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.588511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1391  hemagglutinin-like secreted protein  79.76 
 
 
267 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2213  hypothetical protein  76.19 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2219  putative hemagglutinin-related protein  71.08 
 
 
455 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0473724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1393  hypothetical protein  66.27 
 
 
338 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1319  hypothetical protein  62.65 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0727604  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  61.45 
 
 
3475 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1329  hypothetical protein  63.64 
 
 
77 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.289472  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2211  hypothetical protein  59.04 
 
 
376 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419125  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1321  hypothetical protein  58.33 
 
 
379 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0254771  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2309  hypothetical protein  56.63 
 
 
345 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.432241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1399  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000229634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3537  hemagglutinin-like secreted protein  44.32 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1333  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  90.32 
 
 
915 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>