13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1323 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1416  hypothetical protein  93.64 
 
 		 125 aa  216  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.847283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0918  hypothetical protein  46.15 
 
 		 212 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000705912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1813  hypothetical protein  32.93 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0948  hypothetical protein  42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0933  hypothetical protein  40.74 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1021  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0734575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2020  hypothetical protein  36.54 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1380  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2812  hypothetical protein  43.48 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2895  hypothetical protein  43.48 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0884  hypothetical protein  38.89 
 
 		 202 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0806  hypothetical protein  39.13 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>