9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6129 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6129  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5621  hypothetical protein  62.31 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6073  hypothetical protein  62.27 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2739  hypothetical protein  62.27 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3430  hypothetical protein  61.66 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4087  hypothetical protein  61.96 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3375  hypothetical protein  61.66 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5213  hypothetical protein  61.35 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3910  hypothetical protein  60.24 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>