9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2514 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2624  hypothetical protein  79.79 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.0379727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2649  hypothetical protein  76.19 
 
 		 233 aa  297  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1184  hypothetical protein  79.89 
 
 		 206 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2033  hypothetical protein  72.51 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.952729  decreased coverage  0.000661484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3212  hypothetical protein  75.53 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1483  hypothetical protein  79.35 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3359  hypothetical protein  73.33 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2622  hypothetical protein  68.4 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>