104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0044 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0013    99.51 
 
 
2490 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0068    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0153    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0644243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1090  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0514    99.75 
 
 
1479 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0764    100 
 
 
1486 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1050  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0764997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0905    99.51 
 
 
1485 bp  779    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1000    99.51 
 
 
2927 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1107    100 
 
 
1472 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1241    99.75 
 
 
1489 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.572094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1258    100 
 
 
1487 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1268    99.75 
 
 
1489 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1316    100 
 
 
1486 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1361    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1716    100 
 
 
1487 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1811    100 
 
 
1487 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1833    98.77 
 
 
1470 bp  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1945    99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2009    99.51 
 
 
1487 bp  779    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2086    99.51 
 
 
1515 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2320    99.51 
 
 
1489 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2462    99.75 
 
 
1490 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2487    97.54 
 
 
1489 bp  718    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.45359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2620    99.26 
 
 
1490 bp  777    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2732  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2759  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2809    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2933    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2958    99.51 
 
 
1490 bp  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1018  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3053    100 
 
 
1489 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0009    100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0023  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0044    100 
 
 
405 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.793288  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0129    99.75 
 
 
2927 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0189    99.75 
 
 
858 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.983171  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0229  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0257    99.75 
 
 
1475 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0700    100 
 
 
1486 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0876  transposase  99.75 
 
 
1488 bp  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0928  transposase  99.51 
 
 
1488 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.977799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0991  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0992    99.51 
 
 
1080 bp  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.661981  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1007  transposase  100 
 
 
1488 bp  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>