14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001348 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001348  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000106523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05237  hypothetical protein  82.83 
 
 
99 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0320  hypothetical protein  66.3 
 
 
100 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0615  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4063  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4153  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03807  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4456  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4362  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4404  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5377  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03756  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0881  hypothetical protein  30.61 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4096  hypothetical protein  34.41 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>