17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2924 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2924  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  168  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4027  hypothetical protein  34.57 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2751  hypothetical protein  37.8 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4365  hypothetical protein  44.58 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34273  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0992  hypothetical protein  36.59 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3661  hypothetical protein  39.02 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.447018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32470  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0941416  normal  0.353995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1772  hypothetical protein  42.17 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589676  normal  0.0112604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4135  hypothetical protein  39.02 
 
 
83 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238814  normal  0.655306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4127  hypothetical protein  39.02 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0398  hypothetical protein  35.37 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1957  hypothetical protein  35.37 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1865  hypothetical protein  35.37 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0824713  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2678  hypothetical protein  35.37 
 
 
94 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3278  hypothetical protein  38.27 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180181  normal  0.0675674 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4239  hypothetical protein  38.96 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430781  normal  0.0757216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3869  hypothetical protein  28.05 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>