16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3447 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3447  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  76.6 
 
 
326 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  76.6 
 
 
382 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  76.6 
 
 
382 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  50.98 
 
 
311 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  42 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  46 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  50 
 
 
315 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1062  hypothetical protein  40.43 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144683  normal  0.0450083 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  40.43 
 
 
303 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0167  hypothetical protein  42.86 
 
 
290 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  36.17 
 
 
276 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  36.17 
 
 
276 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5809  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  42.22 
 
 
309 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  36.17 
 
 
196 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>