12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2175 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2175  putative transposase  100 
 
 
44 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1283  hypothetical protein  90.91 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0782139  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2298  hypothetical protein  90.91 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2854  hypothetical protein  90.91 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3055  hypothetical protein  90.91 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0585926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3910  putative transposase  93.18 
 
 
51 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18327  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  55.81 
 
 
292 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  55.81 
 
 
292 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  55.81 
 
 
292 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  55.81 
 
 
292 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  54.55 
 
 
292 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2258  hypothetical protein  48.84 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>