15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1270 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1270    100 
 
 
228 bp  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271292  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1289    87.88 
 
 
1107 bp  67.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0854062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0151    89.47 
 
 
943 bp  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0174    89.47 
 
 
967 bp  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4251    89.47 
 
 
882 bp  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4468  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 
966 bp  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1781    88.89 
 
 
1203 bp  60  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.163398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5093    91.3 
 
 
2114 bp  60  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0373    88.46 
 
 
2218 bp  56  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1534    94.29 
 
 
1027 bp  54  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1381    84.85 
 
 
713 bp  52  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2596    84.85 
 
 
937 bp  52  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1984    85.96 
 
 
958 bp  50.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3274    100 
 
 
1024 bp  46.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4231    91.43 
 
 
1050 bp  46.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.460145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>