18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0547 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0547  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.955356  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  64.18 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  65.15 
 
 
309 aa  95.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  51.52 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  51.52 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  51.52 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0091  hypothetical protein  51.72 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.705309  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  41.79 
 
 
311 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  34.85 
 
 
314 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  35.94 
 
 
298 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  35.94 
 
 
302 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  31.82 
 
 
313 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  35.29 
 
 
298 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  34.38 
 
 
313 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  32.35 
 
 
318 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>