10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1954 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.396026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2920  hypothetical protein  46.01 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5121  hypothetical protein  42.37 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.316808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3263  hypothetical protein  41.81 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0862278  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5238  hypothetical protein  42.24 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2540  hypothetical protein  25.56 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.137359  normal  0.320184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2590  hypothetical protein  29.12 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0991416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>