16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1205 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1205  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / pyrimidine dimer DNA glycosylase  100 
 
 		 142 aa  292  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2949  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.134771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0704  hypothetical protein  60.71 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3486  hypothetical protein  58.45 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1470  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.71 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2927  pyrimidine dimer DNA glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.24 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11900  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.25 
 
 		 154 aa  156  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.97418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0386  hypothetical protein  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15080  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.48 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1958  hypothetical protein  51.05 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0746675  hitchhiker  0.00408107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00360  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.41 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1440  hypothetical protein  52 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0788  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1486  hypothetical protein  52 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0511385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0336  hypothetical protein  37.42 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.072829 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0969  hypothetical protein  31.18 
 
 		 109 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0844404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>