13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10594 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10594  lipoprotein lpqN  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.543099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4282  LpqN  48.44 
 
 
233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4368  LpqN  48.44 
 
 
233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4661  LpqN  48.44 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4816  LpqN  51.7 
 
 
229 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.412903  normal  0.84725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1917  hypothetical protein  51.18 
 
 
233 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5212  LpqN  48.57 
 
 
245 aa  157  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.14833  normal  0.148833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 
587 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  41.44 
 
 
587 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  41.44 
 
 
587 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1366  LpqN  37.07 
 
 
238 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1941  putative lipoprotein  26.44 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.946468  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4785  putative lipoprotein  24.71 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>