16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2419 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2419  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.938318  normal  0.0925394 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2639  hypothetical protein  74.29 
 
 
182 aa  225  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.622524 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2267  hypothetical protein  70.21 
 
 
163 aa  217  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11451  hypothetical protein  60.81 
 
 
157 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.479024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11461  hypothetical protein  60.81 
 
 
157 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1052  hypothetical protein  60.81 
 
 
157 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206074  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  49.17 
 
 
306 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.5 
 
 
320 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0945  hypothetical protein  49.58 
 
 
163 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16201  hemagglutinin-neuraminidase  45.38 
 
 
172 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1493  hemagglutinin-neuraminidase-like  44.54 
 
 
172 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19131  hypothetical protein  43.7 
 
 
169 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1042  redox protein  42.86 
 
 
169 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59101  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0944  redox protein  43.33 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223332  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18041  hypothetical protein  43.33 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15991  hypothetical protein  42.02 
 
 
135 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>