18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2257 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2257  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.105733  normal  0.0762423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4585  hypothetical protein  72.22 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2624  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1164  hypothetical protein  73.08 
 
 
64 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000201442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2194  hypothetical protein  71.15 
 
 
65 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4288  hypothetical protein  71.15 
 
 
69 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.865535  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2256  hypothetical protein  71.15 
 
 
65 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.057034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3076  hypothetical protein  69.23 
 
 
64 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.701159 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17921  hypothetical protein  60.78 
 
 
61 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0177  hypothetical protein  59.26 
 
 
61 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20551  hypothetical protein  57.41 
 
 
61 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17971  hypothetical protein  56.86 
 
 
61 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.288736  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1180  hypothetical protein  57.41 
 
 
61 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.728834  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18141  hypothetical protein  56.86 
 
 
61 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1697  hypothetical protein  56.86 
 
 
61 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17281  hypothetical protein  57.45 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0131  hypothetical protein  58.7 
 
 
46 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0974731  normal  0.0108447 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26011  hypothetical protein  58.82 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>