19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0379 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0379  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  249  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.770103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3052  hypothetical protein  57.89 
 
 
130 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2258  hypothetical protein  51.72 
 
 
138 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3274  hypothetical protein  58.93 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2825  hypothetical protein  58.93 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1686  hypothetical protein  56.25 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5080  hypothetical protein  55.26 
 
 
140 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0249  hypothetical protein  57.89 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.21158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0574  hypothetical protein  51.72 
 
 
136 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2097  hypothetical protein  50.43 
 
 
141 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.900015  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14861  hypothetical protein  40.37 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13791  hypothetical protein  47.27 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15111  hypothetical protein  40.37 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17521  hypothetical protein  45.87 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0896  hypothetical protein  45.87 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18001  hypothetical protein  47.52 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15251  hypothetical protein  39.45 
 
 
138 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1423  hypothetical protein  38.53 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26400  predicted protein  31.43 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0245755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>