19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0342 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0342  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2548  hypothetical protein  51.56 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2222  hypothetical protein  49.25 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0202028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0198  hypothetical protein  48.48 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0357  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0092  hypothetical protein  43.94 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2610  hypothetical protein  42.42 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0438  hypothetical protein  40.91 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0364  hypothetical protein  43.94 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1215  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114015  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3667  hypothetical protein  36.49 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3721  hypothetical protein  36.49 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3743  hypothetical protein  43.94 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4320  hypothetical protein  45.1 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290178  normal  0.397509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4461  hypothetical protein  37.88 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0617  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0633  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4853  hypothetical protein  38.03 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5065  hypothetical protein  36 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>