23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2305 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2305  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  255  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2676  hypothetical protein  78.68 
 
 
170 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30061  hypothetical protein  64.44 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.332074 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18421  hypothetical protein  47.66 
 
 
153 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.605275 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1315  hypothetical protein  49.52 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1995  hypothetical protein  42.96 
 
 
160 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0567045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21881  hypothetical protein  50.48 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1680  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0192  hypothetical protein  43.31 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07181  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07091  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06801  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4804  hypothetical protein  34.59 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0653  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3886  hypothetical protein  38.68 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628079  normal  0.0180315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4895  hypothetical protein  37.04 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2074  hypothetical protein  40.19 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.733964  hitchhiker  0.00407235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0711  hypothetical protein  33.59 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0740  hypothetical protein  33.59 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42552  predicted protein  31.25 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33348  predicted protein  30.16 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16462  predicted protein  32.67 
 
 
176 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385603  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45335  predicted protein  32.46 
 
 
390 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>