14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1344 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1344  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1569  hypothetical protein  68.64 
 
 
236 aa  329  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal  0.0254986 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11481  hypothetical protein  65.96 
 
 
236 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.187149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15831  hypothetical protein  58.05 
 
 
237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0234  hypothetical protein  39.3 
 
 
253 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0620  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602592  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3848  hypothetical protein  37.61 
 
 
233 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4609  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  20.98 
 
 
271 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  20.54 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  25.11 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  23.01 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  25.24 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>