21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1072 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1072  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1427  hypothetical protein  78.72 
 
 
95 aa  150  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0577144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15341  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3373  hypothetical protein  54.95 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  58.54 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0302  hypothetical protein  47.37 
 
 
114 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09741  hypothetical protein  47.37 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.941825  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0895  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.943114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  51.61 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08551  hypothetical protein  45.65 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2745  hypothetical protein  51.69 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09561  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0465015  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09541  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0791  hypothetical protein  48.35 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0921  hypothetical protein  46.32 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_8301  predicted protein  48.75 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10662  predicted protein  48.19 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0262424 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9589  predicted protein  41.25 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215394  normal  0.727181 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8310  predicted protein  43.33 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>