18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0871 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0871  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  179  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1773  hypothetical protein  64.38 
 
 
77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0789147  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12451  hypothetical protein  44.57 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06101  hypothetical protein  45.71 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.117051  normal  0.362162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0064  hypothetical protein  37.65 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11701  hypothetical protein  43.06 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0725555 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0456  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06851  hypothetical protein  37.65 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.213637  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08841  hypothetical protein  32.86 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0702  hypothetical protein  31.94 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0796631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07531  hypothetical protein  30.56 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07511  hypothetical protein  30 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07301  hypothetical protein  32 
 
 
114 aa  48.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0805479  normal  0.14693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2333  hypothetical protein  31.88 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1510  hypothetical protein  30.43 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1537  hypothetical protein  30.43 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.49347  normal  0.0252644 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0625  hypothetical protein  25 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>