13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1871 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1871  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0782  hypothetical protein  67.64 
 
 
346 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17401  hypothetical protein  48.53 
 
 
308 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0200  hypothetical protein  29.27 
 
 
345 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.254238  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08321  hypothetical protein  29.45 
 
 
323 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0328381  normal  0.167174 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09691  hypothetical protein  26.27 
 
 
349 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174636  normal  0.0118465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08561  hypothetical protein  22.42 
 
 
351 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0800  hypothetical protein  21.43 
 
 
351 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08531  hypothetical protein  21.51 
 
 
351 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.620163  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07891  hypothetical protein  22.99 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4147  GCN5-like N-acetyltransferase  24.68 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.273989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2399  hypothetical protein  24.77 
 
 
392 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00753606  hitchhiker  0.00227307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3803  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
414 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.013575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>