16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1778 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1778  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.119903  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0867  hypothetical protein  55.07 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13371  hypothetical protein  82.05 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.721942 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18991  hypothetical protein  38.33 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1029  hypothetical protein  35.71 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13381  hypothetical protein  53.66 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1516  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0470453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06871  hypothetical protein  55.88 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06481  hypothetical protein  54.55 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0622  hypothetical protein  54.55 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06781  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12471  hypothetical protein  40.35 
 
 
70 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.183181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19001  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03721  hypothetical protein  44.12 
 
 
143 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1030  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1572  hypothetical protein  34.78 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102993  normal  0.0541832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>