58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0381 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0381  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4219  hypothetical protein  80.92 
 
 		 133 aa  209  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0278  hypothetical protein  63.57 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3683  hypothetical protein  60.47 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3440  hypothetical protein  57.36 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3671  hypothetical protein  57.25 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0274  hypothetical protein  57.25 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3875  hypothetical protein  57.25 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0588899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0309  hypothetical protein  56.49 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3982  hypothetical protein  57.36 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4091  hypothetical protein  57.03 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0232  hypothetical protein  64.34 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.558206  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4178  hypothetical protein  57.03 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4060  hypothetical protein  56.25 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0395  hypothetical protein  53.49 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3350  hypothetical protein  53.08 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3680  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  38.6 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000277  glutathione S-transferase-related protein  34.88 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2037  hypothetical protein  37.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2428  hypothetical protein  37.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940276  normal  0.0458059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2150  hypothetical protein  37.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.195543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0339  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.9 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2096  hypothetical protein  38.95 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1812  hypothetical protein  38.95 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2264  hypothetical protein  33.87 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2058  hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2118  hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01828  hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2605  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.906436  normal  0.129017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2063  hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1317  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1219  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2100  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1343  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.46281  hitchhiker  0.000563123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01840  predicted inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1771  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000931385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1963  putative inner membrane protein  36.26 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1763  hypothetical protein  36.26 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2437  putative inner membrane protein  34.07 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0640  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.52 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.136353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01106  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  33.6 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.285052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2892  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4532  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2045  glutathione S-transfersae-related protein  29.92 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0632  hypothetical protein  34.17 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2785  hypothetical protein  38.16 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639584  normal  0.118988 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0111  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0704  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  33.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1421  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.26 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573394  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3553  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1964  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1970  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2369  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  30.95 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0204  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  32.65 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2888  hypothetical protein  30.61 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3208  uncharacterized relative of glutathione S-transferase MAPEG superfamily  30.61 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06158  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08370)  35.71 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>