16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1792 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1792  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  213  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0881  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6803  hypothetical protein  42.59 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1131  nitrile hydratase-like  38.67 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.317973  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7181  nitrile hydratase, alpha subunit  40 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423828  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2748  nitrile hydratase, alpha subunit  40 
 
 
209 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6960  nitrile hydratase, alpha subunit  35.59 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2315  nitrile hydratase, alpha subunit  38.71 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7674  nitrile hydratase, alpha subunit  33.9 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2001  nitrile hydratase, alpha subunit  33.93 
 
 
213 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1849  nitrile hydratse subunit alpha  31.34 
 
 
203 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.59953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4916  thiocyanate hydrolase  33.87 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4230  Thiocyanate hydrolase  30 
 
 
253 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2785  nitrile hydratase, alpha subunit  35.19 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0466323  normal  0.468653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2330  Nitrile hydratase  33.33 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1972  nitrile hydratase, alpha subunit  32.61 
 
 
208 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>