14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5240 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5240  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5180  hypothetical protein  53.61 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0737722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4981  hypothetical protein  47.19 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4939  hypothetical protein  49.41 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0562955  normal  0.822719 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9508  hypothetical protein  42.7 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7294  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000759951  hitchhiker  0.000157514 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4663  hypothetical protein  56.36 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4958  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5387  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.800555  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2262  hypothetical protein  35.11 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000133839  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4236  hypothetical protein  44.78 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4080  hypothetical protein  41.79 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0075  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>